La problemática de contaminación del cauce del Río Lerma se debe en gran medida a las descargas directas que recibe, desde descargas domésticas hasta industriales, afectando de manera directa e indirecta la salud humana y el desequilibrio y daño a la biodiversidaden los diferentes ecosistemas a lo largo del cauce.

El saneamiento Integral del cauce es muy complejo y costoso, pero un excelente comienzo es que tanto el Gobierno Federal, los Gobiernos Estatales y sobre todo los municipales a quienes se les delega el tratamiento de aguas, garanticen las Cero descargas directas al cauce. 

Esta sería una acción que acompañada de otras propuestas muy interesantes generarán el rescate u saneamiento del Río Lerma.